Existem muitas opções para isso, gratuitas e muitas dessas de boa qualidade. Mas uma que me chamou atenção: IdleBackup.
Com ele você poderá marcar as pastas e arquivos que deseja para fazer a cópia de segurança, pode agendar uma cópia de X em X minutos ou a partir deste momento num contagem decrescente até ao início do backup.A aplicação fará uma cópia automática apenas dos arquivos alterados, evitando a sobreposição de informação, o que aumenta o tempo para fazer a cópia. Além disso a aplicação poderá ser carregada juntamente com o Windows, fica na barra de tarefas, não incomodando o normal desenrolar do seu trabalho.
Ficam aqui algumas funcionalidades da aplicação:
- Facilidade para fazer cópias de segurança.
- Cópias idênticas (estrutura de pastas), facilitará o acesso.
- A primeira cópia é completa, as seguintes somente os arquivos alterados serão copiados, é o chamado cópia incremental.
- Cópias manuais ou automáticas durante o funcionamento do computador.
- Em modo automático a aplicação funcionará de forma invisível.
- O estado da aplicação será visível na cor do ícone que estará na barra de tarefas.
- Depois de agendada a cópia manual, poderá selecionar desligar o Windows após a cópia terminar.
- Copia os dados dos programas de email (Thunderbird, Outlook, Outlook Express).
- Cópia de e para vários tipos de mídia: disco rígido, pen-drive, rede, etc.
http://idlebackup.nl/ (é gratis!)